冬蟲夏草生長在3500米以上的高山草甸地區，採挖時需要使用鐵鍬在距離草皮7厘米處連草皮深挖，取出冬蟲夏草。因而每條被挖出的蟲草都會在草甸上留下一個十幾厘米見方、9厘米左右深的坑。 冬蟲夏草的採挖季節正是高原草甸的恢復成長期，其採挖對草甸的恢復有很大的影響，若不採取有效的隨挖隨填措施，每採集一根蟲草，至少會破壞30平方厘米的草皮，裸露的泥土極易引起水土流失、草場退化甚至沙化。 與此同時，採挖人員對高原的蟲草主要產地三江源地區的環境也在造成嚴重的污染，採挖者通常在草甸搭帳篷住宿，砍伐灌木生火做飯，必然對脆弱的高原環境造成破壞，加之採挖時的踐踏、車輛碾壓以及紮帳篷、取水、生火、做飯等活動造成的植被破壞，專家估計一名冬蟲夏草採挖者一年就要破壞數千平方米的草地。